EVENTO
Desvendando a virulência de Klebsiella pneumoniae Kp13 através da análise genômica
Tipo de evento: Seminário LNCC
Isolados da enterobactéria Klebsiella pneumoniae, resistentes aos beta-lactâmicos, especialmente aos carbapenens, vêm sendo frequentes nos casos de surtos de infecção hospitalar, restringido as opções para o tratamento de infecções sérias causadas por esse tipo de patógeno. À luz do conhecimento atual, o estudo do genoma dessa bactéria patogênica através do uso das novas tecnologias já disponíveis no país é importante. A disponibilidade da sequência genômica possibilita tanto estudos comparativos quanto abordagens funcionais. Em particular, conhecer o transcriptoma de uma bactéria patogênica é essencial para interpretar quais genes são expressos em diferentes condições ambientais e estados do ciclo de vida celular.Atualmente, no Laboratório de Bioinformática (Labinfo) esta sendo analisado o genoma do isolado multi-resistente (MR) Kp13 de surto hospitalar de K. pneumoniae. Este isolado é produtor da enzima KPC (Klebsiella pneumoniae carbapanemase), sendo sensível apenas à tigeciclina e às polimixinas. O sequenciamento foi realizado em 2010 com o uso da plataforma GS FLX 454 (Roche) de alto desempenho de DNA, localizada na Unidade Genômica Computacional (UGC) no LNCC. Será apresentada a análise do genoma draft de Kp13, o qual consiste de um cromossomo (tamanho estimado em 5,3 Mpb) e de quatro plasmídeos (tamanho total estimado em 600 Kbp). O cromossomo de Kp13 contém genes codificando a enzimas de resistência aos beta-lactâmicos, tais como blaSHV, blaSHV-12, metalo-beta-lactamases, bem como a diversos fatores de virulência. Os plasmídeos são elementos genéticos altamente variáveis, os quais mostram um padrão de mosaico contendo várias sequências de inserção, transposão e fagos. Genes de resistência a múltiples antibióticos codificados nos plasmídeos incluem bla-OXA-9, blaTEM, blaCTX-M-2 e blaKPC. Demonstra-se que no isolado Kp13 a organização genômica do cluster cps (polissacarídeo capsular), o principal fator de virulência desta espécie, é única entre isolados de K. pneumoniae que produzem carbapenemase associados com surto de infecção hospitalar no Brasil.O estudo inclui também um tipo de comparação genômica com duas estirpes clinicas de K. pneumoniae e uma endofítica fixadora de nitrogênio não patogênica humana.
Data Início: 18/04/2011 Hora: 14:00 Data Fim: Hora: 15:30
Local: LNCC - Laboratório Nacional de Computação Ciêntifica - Auditorio A
Comitê Organizador: Marisa Fabiana Nicolas - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC - marisa@lncc.br
